新型コロナウイルスゲノムAI解析
新型コロナウイルスゲノムに対する連続塩基組成に基づくAI解析(BLSOM(一括学習型自己組織化マップ)解析)による学習結果であり,Data Science Journalに2021年に発表した論文の結果となる.
解析データセット:170,190配列(GISAIDから2020年11月4日にダウンロード)
以下の学習結果は,BLSOM Viewerで閲覧可能である.
1.N(ATGC以外の塩基)が10%未満の解析データセットでの解析結果
解析データセット:167,905配列
1-A:5連続塩基塩基頻度での解析結果
1-B:5連続塩基のオッズ比での解析結果
2.N(ATGC以外の塩基)が1%未満の解析データセットでの解析結果
解析データセット:130,753配列
2-A:5連続塩基塩基頻度での解析結果
2-B:5連続塩基のオッズ比での解析結果
本データに対する問い合わせ先
阿部貴志(新潟大学)