[[Bioinformatics Laboratory]]
#author("2022-10-03T02:40:06+00:00","default:abebioinfo","abebioinfo")
新型コロナウイルスゲノムに対する連続塩基組成に基づくAI解析（[[BLSOM（一括学習型自己組織化マップ）>http://bioinfo.ie.niigata-u.ac.jp/?BLSOM]]解析）による学習結果であり，[[Data Science Journal>https://datascience.codata.org/article/10.5334/dsj-2021-029/]]に2021年に発表した論文の結果となる．
解析データセット：170,190配列（GISAIDから2020年11月4日にダウンロード）
以下の学習結果は，[[BLSOM Viewer>http://bioinfo.ie.niigata-u.ac.jp/?BLSOMviewer]]で閲覧可能である．
１．N（ATGC以外の塩基）が10%未満の解析データセットでの解析結果
解析データセット：167,905配列
１－A:5連続塩基塩基頻度での解析結果
-[[学習後のリファレンスベクトル>http://bioinfo.ie.niigata-u.ac.jp/data/DSJ_data/N10/Penta/weight.100]]
-[[解析データセットの分類結果>http://bioinfo.ie.niigata-u.ac.jp/data/DSJ_data/N10/Penta/out_each_clade]]
１－B:5連続塩基のオッズ比での解析結果
-[[学習後のリファレンスベクトル>http://bioinfo.ie.niigata-u.ac.jp/data/DSJ_data/N10/oddPenta/weight.100]]
-[[解析データセットの分類結果>http://bioinfo.ie.niigata-u.ac.jp/data/DSJ_data/N10/oddPenta/out_each_clade]]
２．N（ATGC以外の塩基）が1%未満の解析データセットでの解析結果
解析データセット：130,753配列
２－A:5連続塩基塩基頻度での解析結果
-[[学習後のリファレンスベクトル>http://bioinfo.ie.niigata-u.ac.jp/data/DSJ_data/N1/Penta/weight.100]]
-[[解析データセットの分類結果>http://bioinfo.ie.niigata-u.ac.jp/data/DSJ_data/N1/Penta/out_each_clade]]
２－B:5連続塩基のオッズ比での解析結果
-[[学習後のリファレンスベクトル>http://bioinfo.ie.niigata-u.ac.jp/data/DSJ_data/N1/oddPenta/weight.100]]
-[[解析データセットの分類結果>http://bioinfo.ie.niigata-u.ac.jp/data/DSJ_data/N1/oddPenta/out_each_clade]]
本データに対する問い合わせ先
阿部貴志（新潟大学）